La filière bovine française franchit une nouvelle étape dans la fiabilisation des filiations grâce à l’intégration massive et automatisée des contrôles de parenté issus de l’indexation génomique dans les bases nationales. Cette évolution renforce la cohérence et la qualité des données génétiques mobilisées par l’ensemble du Dispositif Génétique Français.
Des volumes de données inédits désormais valorisés.
L’initiative a permis de reprendre et d’exploiter l’intégralité des contrôles de parenté présents dans SIGENO, la base de données dédiée aux génotypages pour la sélection génomique, soit près de 5,9 millions d’informations brutes. Après traitement :
• 3,2 millions contrôles de parenté ont été intégrés dans la Base ADN, base intermédiaire de stockage des données ADN pour les vérifications de filiation.
• Parmi eux, 1,27 million basé sur des références d’analyses déjà connues en base ont été ont été transmis au BIGRb et mis à la disposition des EDE.
Ces données, auparavant limitées à l’usage interne de l’indexation génomique, deviennent pleinement exploitables dans le cadre du dispositif de la Certification des Parentés Bovines (CPB).
Un flux automatisé pour une mise à jour continue
Depuis décembre 2025, un dispositif technique robuste permet l’intégration hebdomadaire des contrôles de parenté réalisés à l’occasion du calcul des index génomiques dans :
• La Base ADN, qui centralise toutes les vérifications faites quel que soit le contexte.
• Le BIGRb, base interprofessionnelle utilisée par les acteurs du DGF pour la l’enregistrement et la certification des filiations qui valorise les informations de filiation pour lesquelles les conditions de réalisation du prélèvement respectent les règles définies par FGE.
Chaque lundi, un fichier exhaustif issu de SIGENO est transmis automatiquement. Un traitement préalable identifie :
• Les nouvelles informations.
• Les mises à jour.
• Les éventuelles suppressions.
• Et élimine les données non exploitables.
Les informations validées sont ensuite intégrées dans les bases nationales, garantissant une actualisation rapide et fiable pour tous les utilisateurs.
Un projet structurant porté par l’ensemble de la filière
Ce projet repose sur trois piliers complémentaires :
• Volet contractuel : les Organismes de Sélection (OS) ont autorisé GenEval, responsable du calcul des index, à transférer les contrôles de parenté vers les bases nationales.
• Volet technique: un flux automatisé a été conçu entre SIGENO, la Base ADN et le BIGRb, assurant une circulation fluide, sécurisée et standardisée des données.
• Volet opérationnel: les contrôles de parenté issus de l’indexation génomique sont désormais considérés aussi fiables que ceux produits par le module FGE à partir des analyses ADN transmises par les laboratoires, sous réserve que les prélèvements et analyses soient correctement enregistrés dans le BIGRb.
Une comparaison avec les filiations déjà certifiées a révélé un nombre très limité d’incohérences, confirmant la robustesse du dispositif.
Un progrès déterminant pour la fiabilité des informations génétiques.
Cette intégration structurée des données génomiques constitue une avancée majeure pour la filière bovine française. Elle renforce :
• La fiabilité des filiations.
• La cohérence des données génétiques nationales.
• La qualité des certifications de parenté.
• La performance globale du dispositif génétique français.
• Et la cohérence du dispositif en partageant des données au fil de l’eau entre les acteurs.
Elle apporte en outre une garantie supplémentaire de fiabilité des index qui sont très fortement dépendants de la qualité des filiations.
Le lot suivant de ce projet consistera à partager les jeux de 200 marqueurs SNP de l’ADN utilisés pour réaliser les vérifications de filiation. Ces jeux de 200 marqueurs, extraits des génotypages utilisés pour l’indexation génomique, sont déjà majoritairement transmis par les laboratoires et le lot 2 du projet vise à obtenir l’exhaustivité.
Dans un premier temps ces approvisionnements pourront se faire à la demande au coup par coup, l’information de connaissance de cette référence ADN existant désormais dans la base ADN.
France Génétique Élevage et l’ensemble des partenaires du DGF saluent cette étape clé, qui ouvre la voie à une exploitation encore plus fine et plus réactive des données génomiques au service des éleveurs et de la sélection bovine.